全球乳腺癌死亡人數(shù)達(dá)到 68 萬例，占全球女性癌癥死亡總數(shù)的 15.5%，成為全球死亡人數(shù)多的女性癌癥。在中國，乳腺癌也是女性新發(fā)癌癥病例數(shù) 多的癌癥，2020 年新發(fā)病例達(dá)到了 42 萬。

2020 年全球女性癌癥新發(fā)病例數(shù)和死亡病例數(shù)前十的癌癥類型

小編去搜索發(fā)現(xiàn)乳腺癌相關(guān)的文獻(xiàn)數(shù)量大并且逐年攀升，以下 3 篇是在基因組水平的涉及大型乳腺癌隊(duì)列易感基因分析、乳腺癌基因組學(xué)特征、乳腺癌的多基因風(fēng)險(xiǎn)評估。

文獻(xiàn) 1：11 萬樣本關(guān)聯(lián)分析揭示乳腺癌易感基因

標(biāo)題：11 萬樣本關(guān)聯(lián)分析揭示乳腺癌易感基因

時(shí)間：2021/2

期刊：The new england journal of medicine（IF 74.699）

單位：國際乳腺癌學(xué)會聯(lián)盟

平臺：Targeted DNA sequencing（34 genes）

摘要：乳腺癌易感基因檢測已被廣泛應(yīng)用，但是對許多基因而言，與乳腺癌的潛在風(fēng)險(xiǎn)推算商不精準(zhǔn)，并且缺乏可靠的亞型相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)推算。國際乳腺癌學(xué)會聯(lián)盟對來自 25 個(gè)國家 11.3 萬多例女性 34 個(gè)基因與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)進(jìn)行了分析。該人群病例 - 對照研究對 34 個(gè)可能易感基因大規(guī)模并行測序，將這些基因蛋白質(zhì)截?cái)嘧儺惡秃币婂e(cuò)義變異進(jìn)行單獨(dú)分析，比較全部乳腺癌和各個(gè)亞型乳腺癌的比例。全部乳腺癌女性與對照女性相比：5 個(gè)基因（ATM、BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2）蛋白質(zhì)截短變異比例顯著較高（P<0.0001）。4 個(gè)基因（BARD1、RAD51C、RAD51D、TP53）蛋白質(zhì)截短變異比例相對較高（P<0.05）。3 個(gè)基因（ATM、CHEK2、TP53）罕見錯(cuò)義變異比例顯著較高（P<0.001）。3 個(gè)基因（BRCA1、BRCA2、TP53）致病錯(cuò)義變異比例顯著較高，與蛋白質(zhì)截短變異比例相似。這項(xiàng)研究的結(jié)果定義了在臨床中有用的基因，用于乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測，并提供了蛋白質(zhì)截?cái)嘧儺愊嚓P(guān)風(fēng)險(xiǎn)的估計(jì)及指導(dǎo)遺傳咨詢。

文獻(xiàn) 2：8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因風(fēng)險(xiǎn)評估

標(biāo)題：8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因風(fēng)險(xiǎn)評估

時(shí)間：2020/12

期刊：Nature Communications（IF 12.121）

平臺：Illumina / Affymetrix arrays 

摘要：乳腺癌多基因風(fēng)險(xiǎn)評分（PRS) 有可能改善風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測情況，但其在各種臨床情況下的應(yīng)用信息非常有限。本研究團(tuán)隊(duì)在 FinnGen 研究的 122,978 名女性中發(fā)現(xiàn)了 8401 例乳腺癌病例，PRS 改變了兩種高影響力移碼突變的乳腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)。研究發(fā)現(xiàn)在乳腺癌診斷后，PRS 升高的個(gè)體發(fā)展為對側(cè)乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)也相應(yīng)增加，并且 PRS 可以顯著改善其一級女性親屬的風(fēng)險(xiǎn)評估結(jié)果。更為詳細(xì)的研究顯示，在攜帶 PALB2 c.1592delT 突變的女性和平均 PRS（10-90% 百分位數(shù)）女性的終生患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)是 55%，而 PRS 評分高的（> 第 90 個(gè)百分位數(shù)）風(fēng)險(xiǎn)升到 84%（71-97%），PRS 評分低的（<10 個(gè)百分位數(shù)）風(fēng)險(xiǎn)降到 49%（30-68%）。CHEK2 c.1100delC 突變的攜帶者（n=1648）各評分患病風(fēng)險(xiǎn)分別為 29%（27-32%）、59%（52-66%）和 9%（5-14%）。尤其對那些有早發(fā)性乳腺癌家族史的女性，PRS 可以顯著改善風(fēng)險(xiǎn)評估。

文獻(xiàn) 3：轉(zhuǎn)移性乳腺癌的基因組學(xué)特征

標(biāo)題：轉(zhuǎn)移性乳腺癌基因組學(xué)特征

時(shí)間：2021/2

期刊：Clinical Cancer Research（IF 10.107）

平臺：Targeted DNA sequencing（OncoPanel）

摘要：本研究對 926 例原發(fā)性或轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者（212 例 dnMBC 和 714 例 rMBC）進(jìn)行靶向 DNA 測序（OncoPanel）。將未經(jīng)治療的 dnMBC 原發(fā)性腫瘤與發(fā)展為 rMBC 的患者中的原發(fā)腫瘤中的單核苷酸變異、拷貝數(shù)變異和腫瘤突變負(fù)擔(dān)（TMB）與所有 dnMBC 中的 OS 相關(guān)性進(jìn)行比較分析。在按亞型比較原發(fā)性腫瘤時(shí)，與 rMBC 相比，MYB 擴(kuò)增在三陰性 dnMBC 中非常明顯（21.1% vs 0%,P = 0.0005, q = 0.111）。在初級 HR + / HER2 - dnMBC 與 RMBC 的腫瘤中 KMTD2、SETD2 和 PIK3CA 突變更普遍，TP53 和 BRCA1 相對不太普遍。TP53、MYC 和細(xì)胞周期通路基因突變 dnMBC 患者的 OS 更短。三陰性 dnMBC 中高 TMB 與更好的 OS 相關(guān)（P = 0.041）。未經(jīng)治療的 dnMBC 與發(fā)展為 rMBC 的患者的原發(fā)腫瘤之間的基因組差異可能為 dnMBC 潛在的轉(zhuǎn)移潛力和不同的治療敏感性提供了依據(jù)。dnMBC 較差的 OS 相關(guān)結(jié)果說明需要新穎的方法來克服當(dāng)前療法的潛在抗性。

這 3 篇文獻(xiàn)都是基于大樣本量的分析研究，1 篇利用傳統(tǒng)的基因芯片的手段，2 篇利用了性價(jià)比極高、使用越來越廣泛的定制基因 panel 測序的手段，從不同角度揭示了乳腺癌的基因組學(xué)特征和疾病易感基因的研究成果，為后續(xù)研究和臨床應(yīng)用提供參考。其他腫瘤研究也有類似情況，或可借鑒其研究思路。特別地，文獻(xiàn)中應(yīng)用的定制基因 panel 測序因其成本低、個(gè)性化的特點(diǎn)受到了越來越多的青睞。

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