在生物學研究中，幾乎一切都與結構有關，甚至可以說，功能也是結構的產物。因此，以亞細胞分辨率在空間原位進行多組學分析，對于生物學科學研究而言重要性不言而喻。Xenium 原位技術平臺可幫助用戶實現亞細胞分辨率的靶向基因和蛋白表達原位分析。該平臺可以將單分子 RNA 和蛋白檢測的功能與強大的光學元件、數據采集和精確解碼技術相結合，能夠以亞細胞分辨率在整張切片上快速檢測大量靶點的組織原位表達水平。可以兼容多種樣品類型，包括新鮮冷凍（FF）組織和福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織。

1.? 新鮮樣本：需要 OCT 包埋，干冰法或者異戊烷法皆可。

2.? 石蠟樣本：需要送石蠟塊。（與空轉 V2 版本不同，Xenium 樣本只能貼在正式芯片上實驗，而非貼在白片上進行轉片，所以不能直送切片。）

3.? 可貼片區域：10mm*22mm（大框區域 12*24mm，邊上“+”定位點不能被切片覆蓋）。

4.? 可多樣本拼片（但同一芯片選擇的 panel 必須相同）。

Xenium 原位技術 ?Panel 列表

1. 人乳腺癌 panel：280 genes，可再定制 100 genes；

2. 小鼠腦 panel：248 genes，可再定制 100 genes；

3. 目前人和小鼠都有泛組織的 panel；

4. 后續我司也會預定制 panel：腫瘤、免疫、神經方向等。

1.?Xenium 的實驗流程主要分四部分：組織切片、探針雜交與擴增、上機測試、數據分析；

2.? 從組織切片到數據下機所需時間為：6- 8 天（依樣本貼片大小而增減上機時間，樣本覆蓋面越大，上機時間越長）。

Xenium 原位技術 - 下機數據

1.? 網頁質控：基礎信息、提示警告或者錯誤信息；

2.? 擬合的 DAPI 圖像：OME-TIFF（格式）；

3.? 細胞切割和邊界信息：細胞核和細胞邊界坐標；

4.? 亞細胞分辨率轉錄本定位（基因表達）信息：轉錄本定位和細胞分配信息；

5.? 細胞 - 分析物表達矩陣：HDF5? 和 ?MTX（后續可以直接進行分析）；

6.? 后續分析：包含表達水平，細胞定位、分型，聚類，降維分析和差異表達。

1.? 疾病組織異質性的量化評價；

2.? 組織微環境免疫細胞組學深度分析；

3.? 伴隨診斷組織空間標志物的篩選；

4.? 藥物創新靶點的發現和藥物輔助開發。

Xenium 原位技術多組學聯合

1.?Xenium 獨立分析：探究關注基因集（panel）的空間表達特征，解析復雜組織中細胞組成及細胞間的互作，研究特定生理病理結構區域下的基因表達信息。推薦腫瘤、免疫、神經（神經性疾病、或者做感知、認知方向）等研究領域的客戶；

2.?Xenium+ 單細胞聯合分析：解鎖各個細胞群的空間位置信息，更高靈敏度及特異性地挖掘細胞間互作及分子調控機制，對關注基因的表達及目標細胞群（如新鑒定到的細胞亞群）進行亞細胞定位研究；

3.?Xenium 原位雜交 + 空轉：解析亞細胞水平時空基因組學；

4.? 單細胞 + 空轉 +Xenium 原位雜交：對多細胞類型近距離共存區域的細胞類型進行精確定位。

▲在關注非典型導管增生區域（多細胞類型近距離共存區域）時可以清晰的定位八種細胞類型

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