基于加權(quán)共表達的計算,利用平均層次聚類的模塊的劃分,模塊與性狀之間的相關(guān)性,挑選出顯著性的性狀,構(gòu)建相應(yīng)網(wǎng)絡(luò)圖,從而找到與性狀相關(guān)的核心基因。
加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)
尋找協(xié)同表達的基因模塊(module),并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。
樣本數(shù)量在 3 組以上,并且每組的樣本重復(fù)為 3 個或 3 個以上。
1、圖片文件:cluster tree,module relation 等;
2、文本文件:每個 module 的所屬基因,以及基因之間的相關(guān)性;
3、module 之間的相關(guān)性。
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