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伯豪生物
通知 |2024 伯豪時空組學前沿技術系列培訓班(內部培訓班)
發布時間:2024-06-01 瀏覽次數:1791
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培訓時間:2024 年 7 月 10-17 日   

培訓地點:5206 會議室

培訓人員:全體科研工作者

培訓內容:2024  伯豪時空組學前沿技術系列培訓班

主辦單位:上海伯豪生物技術有限公司 / 上海伯豪生物技術有限公司企業科協

指導單位:浦東新區科協

 

議程表

7 月 10 日

單細胞、空轉、質控技術介紹

單細胞技術、空間轉錄組技術講解和應用

Agilent2100、4200 的原理及上機演示

7 月 11 日

R 語言概念及基礎知識·數據簡單操作

R,Rstudio 安裝,R 基礎,R 包安裝

7 月 12 日

單細胞基礎分析

單細胞 Seurat 分析流程(Seurat 介紹和安裝,單細胞數據載入和質控過濾,數據標準化和歸一化,去批次和降維聚類,marker 基因鑒定)

細胞類型注釋

singleR 細胞類型注釋,SCINA 半監督細胞類型注釋

7 月 13 日

數據可視化

Seurat 中的數據可視化,基于 Seurat 對象使用 ShinyCell 自動化生成網頁報告

Spatialfeatureplot、SpatialDimPlot、選取特定樣本

7 月 14 日

單細胞高級分析

monocle2 擬時序分析,cellchat 細胞通訊分析

SCENIC 單細胞轉錄因子分析,GSVA 基因集變異分析

7 月 15 日

空間轉錄組基礎分析

數據標準化和歸一化,數據批次矯正和降維聚類

7 月 16 日

云生信

單組胞云流程(使用、注意事項、參數調整等)

生信小工具(作圖工具、單細胞數據分析小工具)

7 月 17 日

空轉高級分析

空間轉錄組細胞類型映射:RCTD,CELLTREK,MIA

切片上展示細胞互作 -stlearn

空間 CNV 分析 -siCNV

hdwgcna: 空間轉錄組 WGCNA 分析

腫瘤免疫浸潤分析:xcell&cibersort


培訓講師介紹

侯睿  

伯豪生物  CTO

中國醫藥生物技術協會基因檢測分會青年委員。畢業于中國海洋大學遺傳學專業,曾參與多項國家“863”計劃項目和國家自然科學基金項目,發表 SCI 論文 8 篇。在基因組學、生物信息學領域經過 10 多年的專業積累,精通高二代測序和基因芯片技術的應用及數據分析,具有豐富項目經驗。

 

張志鵬

博士   伯豪生物項目拓展經理

參與 CRISPR 診斷相關課題設計及專利申請 10 余項,具有 IVD 和 LDT 產品開發及市場策劃經驗;擅長單細胞多組學和空間轉錄組測序數據分析挖掘;參與發表 SCI 論文 6 篇(其中第一作者 2 篇)。

 

趙瑩    

上海伯豪生物技術有限公司實驗室總監

畢業于清華大學,曾參與多項國家“863”計劃項目和國家自然科學基金項目,發表論文 3 篇,授權發明專利 4 項。在基因組學、細胞生物學等領域有 10 年的專業積累,對樣本處理、二代測序、時空組學技術等生物學技術有著豐富的項目經驗。

 

孟憲欣  

高級工程師   上海伯豪生物技術有限公司產品中心副總經理

畢業于遼寧師范大學,曾參加多項國家科技部“863”項目、國家自然科學基金項目和上海市科委項目,發表論文 8 篇,發明專利 1 項。在科技產品研發上有豐富的經驗,帶領團隊開發了 20 余種產品,涉及樣本保存、提取,外泌體分離,單細胞核分離,微量樣本擴增,甲基化檢測等方面。

 

車王

伯豪生物產品經理                   

畢業于日本廣島大學分子細胞情報學專業。對于研究分子,細胞相關的各類儀器和技術方法都有深入的了解。目前于伯豪生物擔任單細胞測序相關儀器試劑的產品經理一職。

 

王亮

伯豪生物產品線總監

畢業于華中農業大學,曾參與多項國家“863”計劃項目和國家自然科學基金項目,發表論文 3 篇,其中包括參與瑞金醫院的研究項目,成果發表在 brain(IF>11)上,楊樹空間轉錄組研究項目,成果發表在 Molecular Plant(IF=27.5)。在基因組學、生物信息學領域經過 7 年的專業積累,精通高二代測序和基因芯片技術的應用及數據分析,在非編碼 RNA 的功能、單細胞測序、空間轉錄組學大數據挖掘等方向有豐富的項目經驗。

 

董美辰

上海伯豪產品經理

主要負責 Olink 蛋白組學以及空間轉錄組學相關技術的應用與支持工作。曾參與多項國家自然科學基金項目,具有豐富的實驗端經驗及多項研究的數據分析經驗,擅長單組學及多組學聯合應用方向的數據挖掘與方案設計。

 

張玉娟

  伯豪生物產品經理

畢業于華中農業大學,從事基礎醫學相關研究,曾參與多項國家自然科學基金項目,熟悉基礎科研熱點,具有豐富的 SCI 思路設計及數據分析經驗。擅長單細胞轉錄組及多組學聯合應用方向的方案設計與數據挖掘。

 

李寧  

伯豪生物產品經理

畢業于同濟大學,在基因組測序、基因芯片領域 8 年多的積累,精通二代測序和基因芯片技術的應用及分析,協助客戶進行方案設計與數據分析,腫瘤、遺傳病等相關項目經驗豐富。

 

王 昭

上海伯豪生物技術有限公司技術支持經理

東北農業大學細胞生物學專業,曾任職復旦大學附屬中山醫院;主要負責課題:肝癌的靶向治療;放療聯合免疫治療對肝癌的治療效果評價,熟練掌握各種基礎研究手段。參與國家“863”項目:“動物轉基因刪除技術與育種應用研究”,參與國家“863”項目子課題:“轉錄因子介入的轉基因克隆動物研究”,參與完成國家自然科學基金,發表多篇 sci 論文,累計影響因子 IF>30,具備基礎的研發能力及技術手段。

 

 


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