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伯豪生物
龍行龘龘 |935K 甲基化芯片福利來襲
發布時間:2024-02-21 瀏覽次數:5386
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935K 甲基化芯片(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一種全基因組甲基化篩選工具,靶向人類甲基化組最具生物學意義的區域中超過 935,000 個 CpG 位點,同時在其前代產品 Methylation EPIC v1.0(850K)的基礎上極大的提高了向后兼容性。該芯片保留了以單核苷酸分辨率定量分析全基因組 CpG 的能力,同時提供高度準確和精確的甲基化測量,不受測序深度的影響。可使用精簡、用戶友好的 Infinium 甲基化檢測分析多種 DNA 樣本類型,包括從 FFPE 分離的 DNA 樣本。與其他方法相比,Methylation EPIC v2.0 具有可擴展性和更低的單個樣本總成本,因此可用于探究疾病機制和生物標志物的篩選。


活動福利

滿  50 個樣本   送 好禮   

滿  100 個樣本   更有   豪禮加送


項目周期: 自 DNA 質控合格后標準生信分析結果發送 10 個工作日;

交付結果: 標準生信分析報告和原始數據;

DNA 要求: 常規 DNA 總量≥1ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280 在 1.8 左右;不得有其它個體或其它物種的 DNA 或 RNA 污染;溶解在 H20 或 TE (pH 8.0),特殊樣本視具體情況實驗。

活動時間:2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日

活動說明:

1、合同雙方簽訂完成時間必須在活動時間內;

2、單次送樣數目為 8 的倍數;

3、活動最終解釋權歸伯豪生物所有。


935K 芯片優勢

  • 全面的基因組覆蓋范圍: 檢測 > 935,000 個 CpG 位點,全面覆蓋 CpG 島、啟動子、編碼區及增強子。

  • 探針位點的全面優化: 在 EPICv1.0-850K 的基礎上去除了性能不佳的探針,新增 186,000 個 CpG 靶向增強子和超級增強子、更多 CTCF 結合位點、CNV 檢測區域、EPIC v1.0 覆蓋不足的 CpG 島以及常見癌癥驅動突變。

  • 兼容多種樣本類型: 包括 FFPE、新鮮 / 冷凍組織、全血、口腔細胞、cfDNA、唾液和其他樣本類型。

  • 高質量的數據: 沿用了 450K 芯片的 Infinium 技術,同時采用 Infinium I 及 II 探針設計,使檢測范圍最大化。

  • 分辨率高: 單堿基分辨率,可以直接檢測到發生甲基化的準確位點。

  • 可重復性高: 自身技術重復間的相關性以及與 850K 相同探針間的相關性 R2>0.99。

  • 注釋信息: 人參考基因組版本更新到 hg38,GenCode 數據庫更新到 v41 版本。


  • 935K 與 850K 芯片數據相關性

    935K 甲基化芯片檢測能夠檢測到 0.2 的 beta 值差異,假陽性率低于 1%,從而實現了較高的分析靈敏度,同時也具有極好的數據可重現性。

    如下圖:

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    (A)935K 芯片技術重復相關性 R 2>0.99;

    (B)935K 芯片和 850K 的交集探針間的相關性 R 2>0.99;

    (C)935K 芯片數據與甲基化測序(100X 測序深度)的相關性 R 2>96%。


    935K 芯片實測數據展示

    嚴格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(簡稱 935K)操作手冊完成 DNA 抽提、轉化、擴增、雜交洗脫等,質控結果說明雜交實驗過程穩定、轉化率高、熒光信號和結合狀況良好,綜合說明實驗操作穩定,可以進一步做甲基化的數據分析。

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