
伯豪生物每月匯總單細胞文章,希望對各位老師的關注或研究有幫助!4月份單細胞測序相關文獻共收錄36篇(IF>9),我們選取其中5篇與大家分享,并在文末附表中列出文獻發表期刊、研究方向和技術平臺等信息。重要!不用再費時搜索,也不用費力下載,輕松了解單細胞文章信息,文末可領取4月單細胞文章合集!
高通量測序技術的發展為人類疾病機制研究、遺傳病診斷、產前篩查與診斷、腫瘤診斷與治療等帶來了新的應用機遇。全外顯子組測序,是利用序列捕獲技術將全基因組外顯子區域的DNA捕捉并富集后,進行高通量測序的基因組分析方法。
上一回,我們著重講述了為何要進行蛋白檢測。其中幾個關鍵參數大家一定記住了吧!比如在全基因組中,mRNA和蛋白質表達水平之間的相關性很差,在許多研究中的解釋力(explanatory power)徘徊在40%左右。這一回,我們來講述如何進行蛋白質檢測。
之前我們略述了代謝組學的課題設計,按照設計的思路進行實驗后,就需要進行代謝樣本的收集了。今天咱按照不同類型的樣本,給大家提供一點收集的建議。
在有限的細胞核空間中,基因組的大部分是緊密折疊的,僅留下需要轉錄的部分是開放的。打開的染色質,就允許一些調控蛋白(比如轉錄因子和輔因子)跑過來與之相結合。而染色質的這種特性,就叫做染色質的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq是利用高通量測序檢測轉座酶易接近的染色質的技術。 ATAC-seq只需要很少的細胞就能鑒定基因組中所有活躍的調控序列。
DNA甲基化(DNA methylation)是目前研究得清楚、也是重要的表觀遺傳修飾形式,主要是基因組DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基間的共價結合,胞嘧啶由此被修飾為5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。別看這只是一個小小的改變,它所起到的作用卻是巨大的!有些科學家甚至將DNA甲基化叫做“第五種堿基”!
伯豪生物目前已經先后建成DNA甲基化檢測芯片/二代測序平臺、RNA甲基化分析平臺,組蛋白修飾分析平臺、轉錄因子分析平臺和開放染色質分析服務平臺。2012年至今,伯豪生物表觀產品線已經累計為客戶完成約1000例以上科研服務項目,涉及組織、細胞、全血、FFPE等各類實驗樣本約2萬例以上,涵蓋腫瘤、胚胎發育、復雜疾病等各個領域,協助客戶在J Clin Oncol、Nat Commun、PNAS、Ann Rheum Dis等高水平期刊發表論文30余篇,累計影響因子150以上(累計到2020年3月)。下面讓我們一起來欣賞下部分高分文章吧。