在深層皮膚損傷后，哺乳動物的進化為了加速傷口愈合，會產生纖維化疤痕。我們無法再生功能性真皮以及一些功能附屬物是人類皮膚傷口愈合的主要障礙。有趣的是，一些組織擁有再生的能力，例如全層切除皮膚傷口后的新生毛囊(HF)形成已經在小鼠中被證明，這作為一個強大的模型，以了解潛在的皮膚再生機制。哺乳動物的新皮膚修復纖維化瘢痕的形成是由于真皮成纖維細胞占優勢，容易產生過量的纖維胞外基質。因此，確定成纖維細胞的來源對于改善傷口愈合效果的治療至關重要。
結直腸癌（CRC）是常見的惡性腫瘤之一，在我國的發病率位于惡性腫瘤第3位、死亡率排第5位，其發生被遺傳和環境因素共同驅動。目前，結直腸癌的主要治療方法為外科手術治療、輔助放化療，但晚期CRC患者的總體生存率仍然很低。因此，尋找經濟有效的診斷及預后評估指標，為CRC患者提供有效的術后監測以及提高治愈率尤其關鍵。
項目新文|基于GEO、TCGA數據庫研究MARC2抑制肝細胞癌進展的機制：“新型線粒體酰胺肟還原成分2是癌癥的有利指標，通過調節p27的表達來抑制肝細胞癌的進展”文獻伯豪生物客戶解讀。
前面我們有介紹了利用10x Space Ranger軟件分析空間轉錄組原始數據得到可用于下游分析的矩陣和鏡像文件。今天來介紹一下怎么利用Space Ranger的結果文件進行后續分析，這里主要使用Seurat在進行下游分析。
前期軟文我們整理了單細胞核測序（snRNA-seq）相對于單細胞測序（scRNA-seq）的一些優勢，包括細胞類型多樣性，酶解偏好性，樣本類型（冰凍或者新鮮樣本），酶解產生的應激性等方面。涉及的組織主要集中在腦，腎臟和心臟。其實，snRNA測序還有其他的優勢，比如可以更好的研究基質內嵌的間充質細胞；減少線粒體相關基因，管家基因的檢測；以及可以識別更多的lncRNAs。
10x空間轉錄組數據跑完Space Ranger之后都會生成單個樣本的cloupe.cloupe文件，這個文件可以用Loupe Browser來對單個樣本進行可視化，Loupe Browser操作簡單、結果直觀，非常適合不太會寫代碼的老師或同學來自己挖掘數據。
本期的主題是胃腸道腫瘤，為大家搜集了RNA m6A修飾的相關研究，樣本類型有全血、細胞和組織。其中全血樣本的研究主要為了尋找標志物，而細胞和組織通常會結合出現，以便進行深入的機制研究。
伯豪生物通過互聯網收集到8月單細胞測序相關文獻41篇（平均IF>9），于本文末列出單細胞測序文獻發表期刊、研究方向和技術平臺等信息，伯豪生物隨機挑選了其中5篇，供大家查閱，以期望提供更多單細胞測序科研思路給科研領域內的各位科研工作者。
伯豪生物單細胞測序常用研究方向分析，從客戶單細胞揭示胰腺導管腺癌（PDAC）的異質性和惡化發展闡述單細胞測序的熱點及案例解讀，以圖文并茂的方式闡述了單細胞測序科研技術成果，編者寄希望通過單細胞測序的熱點及案例的解讀帶給讀者更加適合的科研視角。
轉眼8月已經過去，伯豪生物為大家精心收集了以DNA甲基化研究為主題的較新研究成果，截止發文，伯豪生物8月以DNA methylation為關鍵詞檢索到文獻一共有536篇，伯豪生物精選了6篇作為重點分享DNA甲基化分析研究寄希望帶給讀者更多的DNA甲基化研究思路，包括帕金森、腸炎、婦科癌癥和植物發育等DNA甲基化內容的研究等。
